Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CHFRQ96EP1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CHFRQ96EP1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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