Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms