Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLD3Q8IV08 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms