Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUM7

NPAS4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS4Q8IUM7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS4Q8IUM7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms