Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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