Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BX284656.1-201ENST00000446364 668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms