Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms