Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms