Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms