Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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