Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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