Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms