Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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