Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRJQ12913 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRJQ12913 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRJQ12913 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRJQ12913 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPRJQ12913 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PTPRJQ12913 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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