Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms