Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms