Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms