Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ID3Q02535 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ID3Q02535 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ID3Q02535 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ID3Q02535 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ID3Q02535 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms