Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms