Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOSBP53539 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms