Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 OR4A48P-201ENST00000531359 391 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms