Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGIRP43119 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGIRP43119 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms