Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MYCNOSP40205 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms