Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms