Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1E1P36543 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATP6V1E1P36543 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms