Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC1P35251 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFC1P35251 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms