Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OTX2P32243 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OTX2P32243 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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