Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFNP31947 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFNP31947 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFNP31947 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFNP31947 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFNP31947 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFNP31947 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms