Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms