Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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MSX1P28360 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MSX1P28360 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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