Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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