Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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