Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCP1P17987 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms