Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms