Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYBBP04839 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYBBP04839 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYBBP04839 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYBBP04839 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms