Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms