Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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