Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms