Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms