Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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