Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms