Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFR3BQ9Y2G0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms