Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms