Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO3Q9UK99 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms