Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN11AQ9UI33 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN11AQ9UI33 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms