Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms