Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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