Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms