Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms