Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms